「刻窟の通行証書」本編です。

主人公、御園生百合子（みそのう　ゆりこ）のショッキングな記憶から、物語は始まります。

あの時何が起こっていたのか。

そして、現在、百合子を導く運命とは？

1. 真紅の記憶
2. 気のせいと謎の女
3. N町にて起こったこと
4. 人外たちと神器使い
5. 傾空
6. 二人の人外
7. 真相
8. 新しい日々と来客
9. 冴祥と暁烏
10. 災いは広がる
11. わたしはカモメ
12. 風放の湊
13. 天地の星宿り
14. 記憶と神器
15. 暁烏vs.グレイディ
16. 剣舞
17. ソーリヤスタ
18. 人形使い
19. 曙色の帳
20. 慈濫
21. 暴走
22. 殺してくれェ
23. 妖精の国へ
24. 怪物
25. 妖精の魔法
26. 月の刃
27. 領主の城へ
28. 推理
29. ドーリーンの供述
30. レイモンドの取り調べと噂
31. 奇怪な襲撃
32. 妖精王と王都での捜査
33. 冴祥と暁烏とエイダ、ついでにナギ
34. 百合子と真砂とアンディの推理
35. 天名とグレイディと猛獣使い
36. トレヴァーを追って
37. 真相とまぼろし大師
38. その頃高月城下では
39. まぼろし大師
40. 高月城
41. 神封じの石
42. 白糸のお繭
43. 百合子の推理
44. 真砂と天名vs.冴祥と暁烏
45. 意外な事実
46. 逃げるまぼろし大師
47. 再び刻窟
48. その理由
49. 市庁舎にて
50. 春希
51. 迷宮と過去の亡霊
52. 天国に続く階段
53. 悪夢の産物
54. 悪夢の終わらせ方
55. 籠城の終わりと海から来たモノ
56. 邪神の最期
57. ある日刻窟市で【完】